内设机构：
根据上述职能，市委政策研究室内设4个科：综合科、经济研究科、社会发展研究科、港澳台与区域合作研究科。
（一）综合科（挂市咨询委员会办公室牌子）
    负责筹划协调全市中长期课题和综合性重大课题的研究，收集编辑国内主要城市和发达国家经济社会发展情况和信息资料，编发《特区探索》、《决策参考》、《调研动态》等内部刊物；负责斗门改革与发展研究；负责本室组织协调、催办督办、对外联络、文秘档案、机要保密、接待会务、后勤保障以及人事、纪检和党务、工青妇、计划生育等工作；负责市咨询委员会办公室的日常事务工作。

（二）经济研究科 
    负责全市经济发展战略、总体规划以及产业发展规划的调查研究；负责工业、财税、金融、商贸、旅游、房地产、物流业等方面的调查研究；负责香洲区、金湾区、临港工业区改革与发展的研究；参与起草市委有关的重要文件、材料。

（三）社会发展研究科 
    负责全市社会发展战略、总体规划的调查研究；负责科技教育、党的建设、文化卫生、城市管理、精神文明、社区建设、劳动保障、法制建设等方面的调查研究；负责珠海国家高新技术产业开发区、大学园区改革与发展的研究；参与起草市委有关的重要文件、材料。

（四）港澳台与区域合作研究科 
    负责对港澳台经济发展、对外经济贸易、招商引资、口岸管理与建设、跨境大型基础设施建设等研究；负责对外经济合作、泛珠三角等区域经济的调查研究；负责珠海保税区、万山海洋开发试验区、横琴经济开发区改革与发展的研究；负责对国际经济有关热点问题研究；参与起草市委有关重要文件、材料。